Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRRC1Q96M27 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms