Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tubb6Q922F4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms