Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pja2Q80U04 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms