Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Dsg1bQ7TSF1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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