Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox11Q7M6Y2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox11Q7M6Y2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms