Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp140Q6NSQ5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Sp140Q6NSQ5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sp140Q6NSQ5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sp140Q6NSQ5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sp140Q6NSQ5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sp140Q6NSQ5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sp140Q6NSQ5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sp140Q6NSQ5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sp140Q6NSQ5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sp140Q6NSQ5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sp140Q6NSQ5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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