Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx3xQ62167 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx3xQ62167 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms