Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms