Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc114Q3UX62 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc114Q3UX62 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms