Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Samd11Q1RNF8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Samd11Q1RNF8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Samd11Q1RNF8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Samd11Q1RNF8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Samd11Q1RNF8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Samd11Q1RNF8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Samd11Q1RNF8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Samd11Q1RNF8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samd11Q1RNF8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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