Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cdx4Q07424 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cdx4Q07424 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms