Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sox8Q04886 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sox8Q04886 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms