Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cldn18P56857 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cldn18P56857 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cldn18P56857 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cldn18P56857 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cldn18P56857 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cldn18P56857 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cldn18P56857 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cldn18P56857 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cldn18P56857 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Cldn18P56857 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn18P56857 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn18P56857 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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