Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms