Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pax9P47242 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pax9P47242 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pax9P47242 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms