Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx1-2P42580 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms