Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp4P35123 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp4P35123 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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