Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2afxP27661 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms