Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSPP15924 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSPP15924 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DSPP15924 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DSPP15924 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DSPP15924 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DSPP15924 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms