Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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