Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Casq1O09165 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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