Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sclt1G5E861 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sclt1G5E861 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sclt1G5E861 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sclt1G5E861 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sclt1G5E861 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sclt1G5E861 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms