Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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H2-M1F7CXU4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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H2-M1F7CXU4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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H2-M1F7CXU4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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H2-M1F7CXU4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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H2-M1F7CXU4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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H2-M1F7CXU4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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H2-M1F7CXU4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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H2-M1F7CXU4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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H2-M1F7CXU4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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H2-M1F7CXU4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
H2-M1F7CXU4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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H2-M1F7CXU4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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H2-M1F7CXU4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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