Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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