Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Patl2A2ARM1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms