Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm27029A2A4P4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms