Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms