Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l2Q9JLG4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l2Q9JLG4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms