Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gtf3c6Q9D8P7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c6Q9D8P7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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