Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sec23bQ9D662 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms