Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc105Q9D4K7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.5 ms