Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Upk1aQ9D132 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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