Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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