Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg3Q9CPX6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms