Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ELF4Q99607 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms