Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1bQ91YK2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms