Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Dnajc28Q8VCE1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Dnajc28Q8VCE1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Dnajc28Q8VCE1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Dnajc28Q8VCE1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Dnajc28Q8VCE1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Dnajc28Q8VCE1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Dnajc28Q8VCE1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Dnajc28Q8VCE1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Dnajc28Q8VCE1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Dnajc28Q8VCE1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Dnajc28Q8VCE1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Dnajc28Q8VCE1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dnajc28Q8VCE1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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