Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX10

Pgam5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgam5Q8BX10 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pgam5Q8BX10 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pgam5Q8BX10 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pgam5Q8BX10 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pgam5Q8BX10 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pgam5Q8BX10 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pgam5Q8BX10 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pgam5Q8BX10 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pgam5Q8BX10 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pgam5Q8BX10 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pgam5Q8BX10 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pgam5Q8BX10 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms