Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc4Q6P2L7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc4Q6P2L7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Casc4Q6P2L7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc4Q6P2L7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc4Q6P2L7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Casc4Q6P2L7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc4Q6P2L7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Casc4Q6P2L7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Casc4Q6P2L7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Casc4Q6P2L7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Casc4Q6P2L7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Casc4Q6P2L7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Casc4Q6P2L7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Casc4Q6P2L7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc4Q6P2L7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Casc4Q6P2L7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Casc4Q6P2L7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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