Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc3Q64519 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc3Q64519 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc3Q64519 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc3Q64519 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc3Q64519 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Sdc3Q64519 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Sdc3Q64519 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sdc3Q64519 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Sdc3Q64519 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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