Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Utp18Q5SSI6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms