Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Trdv4Q5R1A3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Trdv4Q5R1A3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Trdv4Q5R1A3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Trdv4Q5R1A3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trdv4Q5R1A3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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