Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3kQ5GIG6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms