Protein–RNA interactions for Protein: Q4QRL3

Ccdc88b, Coiled-coil domain-containing protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88bQ4QRL3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc88bQ4QRL3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc88bQ4QRL3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms