Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc110Q3V125 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms