Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC051142Q3V0M8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC051142Q3V0M8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms