Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ankrd53Q3V0J4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ankrd53Q3V0J4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms