Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
XylbQ3TNA1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms