Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf3c3Q3TMP1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtf3c3Q3TMP1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms