Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Cass4Q08EC4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Cass4Q08EC4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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